Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spcs3Q6ZWQ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Spcs3Q6ZWQ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms