Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd3Q6ZQK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms