Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinlQ6ZQ12 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NinlQ6ZQ12 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinlQ6ZQ12 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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