Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy1Q6ZQ11 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chsy1Q6ZQ11 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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