Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ino80Q6ZPV2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ino80Q6ZPV2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms