Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ift172Q6VH22 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift172Q6VH22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms