Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms