Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms