Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6PD19 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6PD19 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6PD19 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PD19 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PD19 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6PD19 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6PD19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6PD19 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6PD19 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PD19 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PD19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PD19 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms