Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Caskin1Q6P9K8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Caskin1Q6P9K8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Caskin1Q6P9K8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms