Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sik3Q6P4S6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sik3Q6P4S6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms