Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac10Q6P3E7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms