Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp4r3aQ6P2K6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp4r3aQ6P2K6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms