Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc189Q6NZQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms