Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac4Q6NZM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac4Q6NZM9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms