Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Szrd1Q6NXN1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms