Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CltbQ6IRU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms