Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nckap5lQ6GQX2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5lQ6GQX2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms