Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Carmil1Q6EDY6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Carmil1Q6EDY6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Carmil1Q6EDY6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 823 ms