Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rftn1Q6A0D4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rftn1Q6A0D4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms