Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc5lQ6A068 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc5lQ6A068 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms