Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msl2Q69ZF8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms