Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgefl1Q68EF8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgefl1Q68EF8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms