Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab3ipQ68EF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms