Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Top2bQ64511 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Top2bQ64511 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Top2bQ64511 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms