Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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PtprdQ64487 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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PtprdQ64487 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PtprdQ64487 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PtprdQ64487 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PtprdQ64487 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprdQ64487 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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