Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf260Q62513 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf260Q62513 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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