Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn3Q62471 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn3Q62471 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms