Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20854Q62461 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20854Q62461 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20854Q62461 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm20854Q62461 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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