Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sos1Q62245 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms