Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifna11Q61716 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ifna11Q61716 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifna11Q61716 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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