Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pacsin1Q61644 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin1Q61644 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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