Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Erbb3Q61526 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Erbb3Q61526 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Erbb3Q61526 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms