Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamb3Q61087 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamb3Q61087 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms