Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp4Q60972 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms