Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Laptm4aQ60961 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Laptm4aQ60961 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms