Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kpna1Q60960 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna1Q60960 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms