Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc27a1Q60714 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc27a1Q60714 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms