Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CttnQ60598 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CttnQ60598 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CttnQ60598 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms