Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms