Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdcp1Q5U462 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdcp1Q5U462 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms