Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rabl6Q5U3K5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabl6Q5U3K5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms