Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms