Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Specc1Q5SXY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms