Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms