Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms