Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef6Q5NCJ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms