Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spsb3Q571F5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms