Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms