Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd5Q3V1H9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd5Q3V1H9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms